病菌以菌絲體、分生孢子盤在枯枝潰瘍部、病果及僵果上越冬，借風雨或昆蟲傳到果實上。
以菌絲在被害枝幹、果實和病僵果上越冬。翌春溫度適宜時，產生分生孢子。分生孢子傳播主要靠雨水飛濺，也借風和昆蟲傳播。因病果和樹上的病枯枝是初侵染源。幼果前期抗擴展，不抗侵染；而後期則相反。此病有潛伏侵染特性，故田間發病較晚，一年內有反覆多次再侵染。
病菌以菌絲體、分生孢子盤在枯枝潰瘍部、病果及僵果上越冬，也可在梨、葡萄、棗、核桃、刺槐等寄主上越冬。翌春產生分生孢子，借風雨或昆蟲傳到果實上。分生孢子萌發透過角質層或皮孔、傷口侵入果肉，進行初次侵染。
翌春產生分生孢子，借風雨或昆蟲傳到果實上。分生孢子萌發透過角質層或皮孔、傷口侵入果肉，進行初次侵染。果實發病以後產生大量分生孢子進行再次侵染，生長季節不斷出現的新病果是病菌反覆再次侵染和病害蔓延的重要來源。該病有明顯的發病中心，即果園內有中心病株，樹上有中心病果。病菌自幼果期到成熟期均可侵染果實。一般6月初發病，7～8月爲盛期，隨着果實的成熟，皮孔木栓化程度提高，侵染減少。
一般先在園內形成中心病株，逐漸向周圍蔓延；中心病果則向下呈傘狀擴展蔓延；樹冠內膛較外部、中部較上部病果多。蘋果炭疽病菌具有潛伏侵染特性，病菌從幼果侵入後一般在果面蠟質層下潛伏，直到果實接近成熟、抗病性降低時，才得以擴展致病。
蘋果炭疽病病原菌屬子囊菌亞門，病菌以菌絲體在病果、乾枝、果臺、僵果及潛皮蛾爲害的枝條上越冬。第二年春季，越冬病菌形成分生孢子盤，釋放分生孢子，分生孢子借風、雨、昆蟲傳播，穿透侵入或由皮孔、傷口侵入，一年內分生孢子再侵染多次。
病菌以菌絲體、分生孢子盤在枯枝潰瘍部、病果及僵果上越冬，也可在梨、葡萄、棗、核桃、刺槐等寄主上越冬。翌春產生分生孢子，借風雨或昆蟲傳到果實上。分生孢子萌發透過角質層或皮孔、傷口侵入果肉，進行初次侵染。果實發病以後產生大量分生孢子進行再次侵染，生長季節不斷出現的新病果是病菌反覆再次侵染和病害蔓延的重要來源。
炭疽病菌主要在果臺枝、枯死枝、僵果等部位越冬。翌年5月、6月遇持續時間較長的陰雨天，越冬病菌即可大量產生孢子，並隨雨水傳播、侵染幼果。6~10天后，初侵染果實發病，併產生大量分生孢子進行再次侵染。同時也能從傷口侵染，侵入成功率高。病菌侵染後生長擴展快。夏季高溫、高溼條件下，炭疽病的潛育期最短只有3天。
