1.1因地制宜種植早熟品種。施用充分腐熟的有機肥，採用配方施肥技術，有降低發病的作用。與豆科、禾本科作物進行3～5年輪作。1.2選用無病種子，從無病果實上採種。在定植前用如金種植專用（原液）浸泡辣椒根系，然後定植，可以使得辣椒根系強壯，辣椒植株濃密茂盛。1.3定植後溫度控制在20～30℃、地溫25℃、溼度不高於90％。使幼苗茁壯成長。1.4採取高畦（壟）栽培。避免大水漫灌，雨後及時排水，防止田間積水。灌水和雨後及時中耕鬆土，增強土壤通透性，促進根部傷口癒合和根系發育。
選擇合適的地塊，將其整理好之後作爲育苗的地塊，然後選擇優質的辣椒品種，並對種子進行浸種處理，在適宜的時期播種；實行與豆科、禾本科作物進行3-5年的輪作；對土地進行精耕細作，悉心培育壯苗，在移植時儘量不傷根，移植後精心整理，保證土壤不積水漚根，並施足基肥；適時澆水，防止地上和植株內的水分蒸發。
在種植時，應自育無病幼苗進行移植，做好田間管理。如果發病，及時拔除病株，並噴施惡黴甲霜水劑或咯曲腈懸浮劑等藥劑。
爲預防卵菌引起的根部病害，可採用定植前蘸盤的方法，用霜黴威鹽酸鹽水劑+惡黴靈+甲殼素、生物菌、氨基酸類生根劑。發病初期可用甲霜.霜黴威、王銅.甲霜靈、甲霜.惡黴靈咯菌腈或乙酸素噴淋根部防治，一週後再用枯草芽孢桿菌、哈茨木黴菌等微生物類殺菌劑和生根劑一起噴淋根部。
辣椒根腐病多發生於定植後。發病初期病株枝葉特別是頂部葉片稍見萎蔫，傍晚至次日早晨恢復，症狀反覆數日後葉片全部萎蔫，但葉片仍呈綠色。病株的根莖部及根部皮層呈淡褐色及深褐色腐爛，極易剝離，露出木質部；橫切莖觀察，可見維管束變褐色，後期潮溼時可見病部長出白色至粉紅色黴層。
