所謂不打農藥的病蟲害防治一般稱爲農業防治，是相對於化學防治的一種防治方法。是爲防治農作物病、蟲、草害所採取的農業技術綜合措施、透過調整和改善作物的生長環境，以增強作物對病、蟲、草害的抵抗力，創造不利於病原物、害蟲和雜草生長髮育或傳播的條件，以控制、避免或減輕病、蟲、草的危害。對於棉花而言，常用的農業防治方法有以下幾種。
一、合理作物佈局，改善耕作制度
合理佈局、輪作倒茬，加強中耕除草，增施充分腐熟的有機肥，及時拔除病株、摘除病葉，保持棉田清潔，降低病蟲源數量。棉花合理調控，不旺不衰，健康栽培，能極大的減少病蟲害的發生機率。加大防護林建設力度，改善農區生態環境，以利天敵的生棲。科學調整作物佈局，合理安排耕作制度，達到增益減害的目的。擴大抗病蟲的棉花新品種種植面積。大力推廣棉田生態帶種植,達到增益控害的目的。
二、鏟埂除蛹
鏟埂除蛹是消滅蟲源的有效途徑，爲消滅蟲源，減少蟲口基數。是一項行之有效的防治病蟲害的措施，也爲即將到來的春耕春播工作奠定基礎。棉鈴蟲和地老虎等蟲害喜歡在向陽田埂邊越冬，紅蜘蛛早春也會在田埂雜草上出蟄繁殖。在棉花播種前後，及時清理田間地頭地邊的雜草，將田邊地埂剷除虛土，培土修埂，能減少棉鈴蟲、地老虎、紅蜘蛛等蟲害的發生。
三、剷除雜草
剷除雜草有些害蟲在棉花收穫後，常常轉移到田間及周圍雜草上越冬，而到早春，這些雜草又往往成爲越冬害蟲繁殖危害的“庇護所”和寄主。有關專家曾在棉田周圍的雜草上作過調查，每平方米竟有越冬地老虎8～15頭，棉紅蜘蛛在早春雜草寄主上，百株蟲（卵）量高達1194頭。因此，冬春結合積肥造肥，剷除田內外雜草，或者在早春對雜草進行噴藥處理，是防治越冬害蟲的有效措施。
四、棉田深翻
冬季深翻既是棉花增產的重要措施，也是消滅越冬棉鈴蟲的有效方法。冬耕時間越早越好，一般在前茬作物收穫後就要抓緊進行，在大地封凍前（凍土層超過5釐米）耕完，以延長風化時間，提高滅蟲效果，並有利於多接納雨雪。耕翻深度一般應在10釐米以上。冬耕越深，滅蟲效果越好。
五、棉田冬灌
冬耕後接着冬灌，不僅能沉實、風化土壤，而且能提高越冬蛹的死亡率。據中國農科院研究，土壤相對含水量在40%時，棉鈴蟲蛹死亡率爲35.7%，成蟲羽化率爲40%；土壤含水量在70%時，棉鈴蟲蛹死亡率爲46.7%，成蟲羽化率爲33.3%；當土壤含水量達到飽和狀態時，蛹的死亡率爲100%。另有資料表明，冬耕冬灌的地塊，棉鈴蟲蛹越冬死亡率在80%左右，只耕不灌的地塊越冬死亡率爲60%～70%，不耕不灌的地塊只有30%～40%。
