水稻是喜水作物，然而水稻的各個生育階段對水的需求是不同的。水稻全生育期總需水量是從幼苗到孕穗期逐漸增多，孕穗期到黃熟期逐漸減少，孕穗期是需水量最多時期。水稻在一生中有兩個時期不需水層，第一個時期是從萌芽至三葉期，此時土壤含水量達70％爲好；第二個時期是分櫱末期，幼穗分化前最好落幹曬田，控制無效分櫱，促根壯稈。
一、泡田期水層管理
泡田沖洗一般在收割後到上大凍前和化凍後到播種前兩段時間進行，泡田沖洗水量應視鹽鹼輕重而定，新稻田水量一般佔總用水量的20％左右，老稻田用水量可適當少些，一般在5釐米水層即可。春泡田5天-7天后，進行水耮地，待插秧田應保持3釐米-4釐米水層，有利於提高水層溫度，促進稻苗返青。
二、幼苗期水層管理
種子出芽階段具有旱長根、水長芽，熱長根、冷長芽，有氧長根、無氧長芽的生理特性。因此，應保持土面溼潤，以水保溫，補水灌溉爲好。
水稻苗期抗鹽能力最弱，對鹽份十分敏感，採用大中棚鉢體育苗技術有利於水分管理，能夠培育壯秧，增強抗逆性。對直播田，在種子發芽到三葉期一般保持3釐米-4釐米水層補水灌溉爲好，當幼芽長1釐米-2釐米時，落幹曬田3天-5天，通氣增氧，有利於紮根，促進幼苗健壯生長。
三、分櫱到拔節期水層管理
泡田耙地後一週，是插秧的最佳時機，此時應保持3釐米-4釐米的水層，有利於生溫、供氧。返青後，應保持淺水層以利分櫱，水層深度以水稻第二葉露出水面爲好，淺灌水能使低位節間順利分櫱。當返青25天左右，輕曬一次田，以田面結皮即可，促使根系發育和下扎。
四、孕穗期到抽穗期水層管理
此期是水稻生育最旺盛時期，蒸騰作用強，是水稻一生生理需水最多時期，也是水稻抗旱性最弱的時期，缺水將影響穎花分化，幼穗發育，造成穗小，早衰而減產。初穗期植株生長正常時，灌5釐米-6釐米活水有利於抽穗，在抽穗前5天，進行間歇性灌水，以補充土壤中氧氣，排出有毒氣體，增強根系的生理機能。若遇低溫，應加深水層到15釐米-20釐米，使穎花處於水中，免遭低溫冷害，低溫過後，應及時排水，恢復正常灌水。
五、灌溉結實期水分管理
此期是水稻籽粒形成期，主要是促早熟，提高結實率及粒重，應採用乾乾溼溼間歇灌溉法，水層不超過5釐米，達到三天有淺水，二天無水層，充分供給氧氣，防止根系早衰，保持活稈成熟。到了蠟熟後期停灌，黃熟初期排幹水。停水時間不必過早，否則會直接影響產量和米質。對排水不良的粘質土或低窪地到抽穗25天左右就應停灌，漏水田砂質土要延長灌水時間。
總之，水稻田間水管理，應根據不同土壤類型，不同肥力狀況，看苗、看地、看天、看水、看種等進行合理灌溉，保證水稻全生育期生長旺盛，最終達到節水、高產、增收的目的。
