一、母種、原種、栽培種的製作過程
1．母種：母種也就是一級菌種，它的製作大致經過以下幾個過程：培養基配製→培養基滅菌→子實體分離或菇木分離或孢子分離→培養→轉管純化培養→母種。
①母種培養基配製。應根據不同食用菌的不同營養需要配製不同的培養基。常用的配方有：配方1：土豆葡萄糖瓊脂培養基(簡稱PDA培養基)：土豆(即馬鈴薯)200克、葡萄糖20克、瓊脂(凝固劑)20克；配方2：土豆蔗糖瓊脂培養基(PSA培養基)：土豆200克、瓊脂20克、水1000毫升、蔗糖20克；配方3：土豆胡蘿蔔瓊脂培養基(PCA培養基)：土豆20克、胡蘿蔔25克、瓊脂20克、水1000毫升；配方4：土豆瓊脂培養基(PA培養基)：土豆250--300克、瓊脂20克、水1000毫升。②母種分離。即通常將食用菌的子實體、土壤中的菌根、菌素分離或進行菇木分離或擔孢子分離，然後在培養基上培養，得到母種。③母種擴大培養。用上述方法得到的母種數量有限，往往不能滿足生產上的需要，因而需要透過接種來擴繁一批母種供生產用。
2．原種：原種也叫二級菌種，是由母種接種到瓶子或塑料袋裏，經培養後得到的菌種。製作原種的目的，一是爲了擴大種量，滿足生產上的需要；二是讓菌絲對各種秸稈類物質具有適應能力，並在適應的同時產生各種酶類；三是在培養過程中還可以對菌種的生命力、純度等進行檢驗，存優棄劣。透過接種，一支母種可擴接3--5瓶原種。
簡要介紹幾種原種培養基配方：①鋸末培養基：鋸末(闊葉樹)78％、米糖(或麥麩)20％、糖(紅糖或白糖，下同)1％、石膏粉1％，水適量；②棉子殼培養基：棉子殼78％、麥麩或米糠20％、石膏粉1％、糖1％，水適量；③鋸末玉米粉培養基；鋸末(闊葉樹)90％、玉米粉8％、糖1％、石膏粉1％，水適量；④稻草段培養基：稻草段78％、米糠或麩皮20％、石膏粉1％、糖1％；⑤鋸末、棉子殼混合培養基：鋸末40％、棉子殼40％、麥麩18％、石膏粉1％、糖1％，水適量；⑥酒糟培養基：幹酒糟40％、棉子殼(或鋸末)40％、麥麩18％、石灰1％、糖1％，水適量。
3．栽培種：栽培種是直接用於生產栽培的菌種，也叫三級菌種或生產種。栽培種比原種的需要量更大，所用的培養基配方和製作方法與原種相同，將發滿瓶的原種，接種到栽培種瓶子或薄膜袋裏即可得到栽培種。一般每瓶原種可擴接60--100瓶栽培種。
二、菌種生產所需的條件
1．無菌室：無菌室一般不宜過大，4--6平方米即可。與無菌室相連還應有一個1--2平方米的緩衝室相配套。可用藥品或紫外燈對其殺菌消毒。
2．無菌箱：也叫接種箱。大小和規格依具體條件而定，有單人式、雙人式、4人式等。一般雙人操作式較爲普遍。農村專業戶可以製作一個單人操作式。
3．接種工具：常用的接種工具有酒精燈、接種器等。接種器包括接種鏟、接種勺、接種鉤等。
4．藥品：①酒精。除供酒精燈燃燒用外，主要用於手、接種器的消毒。②甲醛。一般配成37％的溶液即福爾馬林用於接種箱的消毒。③石碳酸，也叫苯酚，常用5％的水溶液進行接種箱和無菌室的噴霧消毒，或配成0．5％--1％的溶液，用於洗涮器皿、桌面和工作服，以達到消毒目的。④漂白粉。常用10克漂白粉加水140毫升，靜止1--2小時後取上清液，用噴霧消毒無菌室。⑤新潔爾滅。常用0．25％濃度溶液進行面板和不能以高壓滅菌的器具的消毒，也可用於接種箱和無菌室的噴霧消毒。
三、消毒與滅菌
因爲自然界裏到處有微生物的存在，如空氣、所有原料、水以及一切用具和器具的表面，這些微生物對食用菌菌種而言，都屬於有害菌，即通常所說的雜菌。我們製作的菌種，要求絕對不能染上雜菌，所以必須進行嚴格滅菌。
1．加熱滅菌法：普遍使用的一種方法是常壓一次滅菌法，所需設備簡單、投資少、成本低，適合我國農村使用。此法只要砌一個鍋竈，買一口大鍋，做幾個蒸籠就可以了。把待殺菌的物品放入蒸籠裏，從上氣開始，保持蒸煮6--8小時，即可達到滅菌的目的。
2．紫外線滅菌法：開紫外燈30--40分鐘，基本上可達殺菌目的，距照射物的距離以不超過1.2米爲宜。注意紫外線對人體有傷害作用，所以不能用眼睛直視開着的紫外線燈，也不能開着燈工作。
