猝倒病：可用甲霜靈可溼性粉劑、殺毒礬可溼性粉劑、百菌清可溼性粉劑防治。
青枯病：每株使用鏈黴素50毫升灌根，每10-15天一次，連續施用2-3次即可。
黑脛病：可用58%甲霜靈錳鋅可溼性粉劑500倍液均勻噴霧防治。
炭疽病：發病前可用波爾多液預防，發病後可用克菌丹可溼性粉劑或多氧黴素。
一、猝倒病
1、症狀：主要危害煙苗，病苗在近地面處呈褐色水漬狀腐爛。病苗像開水燙過一樣，成片的病苗變成暗綠色，萎蔫倒伏、腐爛，在溼潤條件下病原菌向周圍擴展，致使煙苗成片發病。
2、防治方法：發現苗牀點發病時，可選用25%甲霜靈可溼性粉劑500-600倍液，或64%殺毒礬可溼性粉劑500倍液，或75%百菌清可溼性粉劑1000倍液，或40%乙磷鋁可溼性粉劑250-300倍液噴施。
二、青枯病
1、症狀：菸草青枯病爲維管束病害，典型症狀爲枯萎，病株多爲單側枯萎，拔出後發病的一側支根發黑腐爛，未發病的根系大部分正常。
2、防治方法：採用200單位農用鏈黴素每株50毫升灌根，每10-15天一次，連續施用2-3次，有一定防治效果，600倍青枯靈灌根同時莖部噴淋、根區土壤噴淋。
三、黑脛病
1、症狀：幼苗染病，莖基部出現污黑色病斑，或從底葉發病沿葉柄蔓延至幼莖，引致幼苗猝倒。溼度大時病部長滿白色菌絲，幼苗成片死亡。
2、防治方法：苗牀在移栽前用58%甲霜靈錳鋅可溼性粉劑500倍液均勻噴霧。移栽後1個月內，零星發病時，用高科30%甲霜惡黴靈600倍液噴霧葉面或去掉噴頭噴淋莖基。或在移栽時，每畝用95%敵克鬆100-200克拌細土5千克，將藥土撒施於煙株莖基周圍，並用土封實。移栽後或培土前可噴58%甲霜靈錳鋅、95%敵克鬆可溼性粉劑500倍液。
四、炭疽病
1、症狀：在菸草各生育期可發生，但以苗期發生普遍嚴重。幼苗葉片病斑密佈，嚴重發病時常破壞煙苗整體，一般發病時雖不至於苗毀，但幼苗生勢差，而且移栽大田後仍可繼續爲害，招致較大損失。
（2）防治方法：在發病前可用波爾多液進行預防。發病後，可用50%的克菌丹可溼性粉劑500倍或多氧黴素480噴霧，防治如果可達90%以上還可用50%退菌特可溼性粉劑800倍液，或75%百菌清可溼性粉劑500-800倍液，或50%代森鋅、80%炭疽福美或50%福美雙可溼性粉劑均用500倍液噴灑。
五、普通花葉病
1、症狀：自苗牀期到大田成株期均可發生。移栽後20天到現蕾期爲發病高峯，打頂後田間病株仍有上升的傾向，但主要在煙枝上出現症狀，害處不大。幼苗被侵染後，新葉的葉脈組織變成淺綠色，呈半透明的“明脈症”，迎光透視可見病葉大小葉脈十分清晰，幾天後葉片形成黃綠相間的“花葉症”。
2、防治方法：用（2萬單位）/（毫升）寧南黴素進行葉面噴霧，也可用0.1%褐藻酸鈉或0.1%硫酸鋅與0.3%尿素相隔3-4天交替噴施2-3次。
