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病菌以卵孢子在12-18釐米表土層越冬,並在土中長期存活。翌春遇有適宜條件萌發產生孢子囊,以遊動孢子或直接長出芽管侵入寄主。此外,在土中營腐生生活的菌絲也可產生孢子囊,以遊動孢子侵染瓜苗引起腐黴猝倒病。田間的再侵染主要靠病苗上產出孢子囊及遊動孢子,借灌溉水或雨水濺射傳播蔓延,病菌侵入後,在皮層薄壁細胞中擴展,菌絲蔓延於細胞間或細胞內,後在病組織內形成卵孢子越冬。病菌借雨水、灌溉水傳播,帶菌的肥料、農具也能傳病。
溫度低,溼度大,土壤板結易發病。
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