1.綿腐病。該病害主要侵染南瓜果實，侵染後，果實表面會出現水漬，隨後擴展爲黃色或褐色的水漬，果實腐爛、潮溼的環境中，還會長出濃密的白色絮絲。2.褐斑病。病害主要危害葉片、原生浸水斑、黃褐色或灰白色、邊緣褐色、圓形或不規則形狀、潮溼環境，嚴重時還會出現稀疏的灰白色黴菌，3.蔓枯病。病害主要危害葉片、莖、藤和果實。葉面受侵染後，病害斑呈淺棕色至黃褐色圓，後期易穿孔，莖藤病斑呈梭形或橢圓形，淺棕色，莖腐病、藤腐病後期全株死亡。4.猝倒病。病害主要發生在南瓜苗期，枯水點出現在莖基部，後期變爲黃褐色，病部出現軟腐，明顯收縮，後期突然脫落，表皮易脫落，溼環境中也長有白色棉絮。
南瓜病蟲害防治重在預防，結合栽培防治、物理防治、生物防治等措施，適時施用農藥控制。
