西瓜枯萎病一旦發出，基本是無藥可治，只能儘快拔除。
西瓜枯萎病化學防治:可發病初期選用戊唑醇、噻菌靈、農抗120、多菌靈、咪鮮胺、甲基硫菌靈等藥劑進行澆根，結合病情防治1-3次。
發病初期在苗期和成株期分別用1%抗枯寧20毫升或用70%惡黴靈可溼性粉劑5克，對水10-15千克，每株50-150毫升/次，連灌2次。
發病初期可用銅製劑，惡黴靈防治，七天後重新噴一次。
西瓜枯萎病發病初期可以用多菌靈進行防治。
西瓜枯萎病可用多菌靈或惡黴靈等化（預）防，嚴重病株應立即拔除。
西瓜枯萎病，用甲硫福美雙或精甲咯菌腈防治，以防爲主。
西瓜枯萎前期可治，後期不行了。
70%惡黴靈可溶粉劑1500倍液灌根或85%三氯異氰尿酸可溶粉劑或6%春雷黴素可溼性粉劑300倍灌根或4%嘧啶核苷類抗菌素水劑400倍灌根。
使用殺菌劑如惡黴靈、甲基硫菌靈加五氯硝基苯等澆根防治。
