發病初於莖基或根部產生褐斑，逐漸擴大後凹陷，嚴重時病斑繞莖基部或根部一週，致地上部逐漸枯萎；縱剖莖基或根部，導管變爲深褐色，後根莖腐爛，不長新根，植株枯萎而死，本病在結果期可引起綿酸病。
番茄疫黴根腐病發生初期於莖基部或根的上部產生褐斑，逐漸擴大後凹陷，嚴重時病斑繞莖基部或根都一週，地上部逐漸枯萎。縱剖莖基部或根部，導管變爲深褐色，後根莖腐爛，不長新根，植株枯萎而死。該病屬真菌性病害，發病與天氣有直接關係，溫度低、溼度大、陰天持續時間長、棚內通風不良都能導致病情迅速蔓延。
番茄根部變爲深褐色。後根莖腐爛不長新根，最後枯死。
番茄根部變爲深褐色，根莖腐爛不長新根，最後枯萎死掉。
