發現潛葉蠅危害，選擇具有內吸作用的藥劑樂果噴霧防治。
水稻生長期中潛葉蠅的防治方法可以使用樂果噴霧防治。
防治潛葉蛾類用25％的天達滅幼脲3號、5%的通脲5號、20%氟鈴脲、2%的天達阿維菌素最有效，並且這些藥劑都屬於生物農藥，有抑制害蟲幼蟲蛻皮的功能。
水稻潛葉蠅的防治方法可物理方法和化學方法同時進行。
可以用阿維菌素或滅蠅胺或滅蠅胺.殺蟲單或阿維菌素與滅蠅胺的復配劑等藥加有機矽噴霧防治。建議用藥：阿維菌素3.2％+滅蠅胺30％（懸浮劑）+有機矽，效果很好。
水稻潛葉蠅主要是在苗床後期移栽前2~3天噴長效藥防治。
水稻出現潛葉蛾應該使用樂果進行噴灑。
防治水稻潛葉蠅可以選擇內吸性殺蟲劑，比如吡丙醚，也可以在苗床施用25%的噻蟲嗪，插秧前帶藥下田。
化學防治措施：實行帶藥移栽，可在插秧前2-3天噴施滅蠅胺、阿維·吡蟲啉等藥劑提前預防，對潛葉蠅有很好的防效。
插秧前1-2天，用10%吡蟲啉3000倍液或40%氧化樂果1000倍液，或100平方米艾美樂5-6克或25%阿克泰水分散粒劑6克兌水1.5升噴霧防治，苗床預防，事半功倍。也可用酷畢30-40毫升兌水1.5升噴霧或3%啶蟲咪乳油每畝30毫升，兌水15公斤噴霧防治。保證秧苗帶藥移栽到本田。
